1998，華恩醫藥集團兼並徐州淮海制藥廠。
2002年，懷藥由國有企業轉制為民營企業，命名為徐州益海藥業有限公司。
2004年，華恩醫藥集團投資5000萬元在徐州經濟開發區建立了全新的生產基地，並通過了1998的GMP認證。
2006年，公司更名為江蘇益海藥業有限公司。
2010年，公司開展立體化招商思路，企業實行扁平化管理，連續三年實現銷售增長35%以上，員工向心力逐漸聚集提升。
2013年，公司決定提前準備2010版的GMP認證，並於11通過現場檢查，於2014年2月取得證書。這比國家規定的時限提前了兩年，意味著企業的生產質量管理達到了較好的水平。
2014年，公司率先通過新版GMP認證，給公司帶來了大量的機遇。公司先後與香港泰和堂、南京同仁堂達成戰略合作，為益海的發展奠定了堅實的基礎。