公司下設九芝堂醫藥貿易有限公司、湖南九芝堂藥業有限公司、湖南九芝堂零售連鎖有限公司、常德九芝堂藥業有限公司、湖南九芝堂思奇生物制藥有限公司、海南九芝堂藥業有限公司、成都九芝堂金鼎藥業有限公司等九家子公司。
九芝堂商南植物藥有限公司、成都九芝堂金鼎藥材種植貿易有限公司；2家分公司:九芝堂印刷包裝分公司、九芝堂對外貿易經濟合作分公司；1持股公司:海南神農大豐種業科技股份有限公司截至2004年末，公司總資產為654.38+0.34億元，凈資產為654.38+0.1.40億元。已發展成為具有壹定規模的工商企業。