昆明制藥集團，原名昆明制藥廠，現為大型國有控股企業。現在所轄的昆明制藥、貝克諾頓制藥、昆明中藥廠也是知名藥企。其中，只要昆明貝克諾頓是由昆明制藥與美國ivax公司合資的制藥企業。也是雲南首家中美合資制藥企業。
雲南醫藥工業股份有限公司也是國有控股公司，旗下有兩個全資子公司:雲南植物藥業股份有限公司和昆明振華藥業股份有限公司；參股公司:昆明吉大制藥有限公司..這三家公司都是雲南著名的醫藥企業，其中昆明濟大制藥有限公司是香港濟華藥業與雲南醫藥工業有限公司合資的企業。
昆明賽諾制藥有限公司也是國企改制，也是非常有名的醫藥企業。
昆明滇紅制藥有限公司是中美合資制藥企業的典範。
雲南綠a生物制藥有限公司是民營企業的典範。這些都比較大，比較有名。還有很多其他的，比如盤龍海雲，龍潤，豪邦等等。，這個不能說。