在企業管理方面，呂衛平有著獨特的眼光和魄力。為改變原國有科研事業單位體制下的用人機制和觀念，2000年在烽火通信公司成功領導了“定崗、定編、定員”工作，並借助IPE(國際崗位評價體系)成功改革了公司薪酬制度。2001，公司開始倡導“服務文化”。為了推動公司從“技術導向型”企業向“客戶導向型”企業轉變，建立了適應市場需求的績效評價體系和激勵體系，以及配套的企業管理信息平臺。兩年內，帶領“烽火通信”成為國內通信行業的知名品牌(被業界稱為“大中國，烽火遍地”)。2001年7月，烽火通信成功發行股票，募集資金超過18億元。
過去長期從事科研開發管理工作，參與和領導研發工作，成績顯著:在武漢郵電學院負責組織系統科研項目的開發和研究；曾參與光纖接入網的研究，是郵電部接入網技術專家組成員。在組織的眾多項目中，有國家863項目和五年計劃，如SDH系列設備和光纖接入網設備的研發。
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