南通站主要辦理寧啟、滬通、童眼、舒同永嘉、北姜妍鐵路的始發和到達，同時也辦理本地區部分途經寧啟、北姜妍鐵路的列車。南通西站主要辦理通過寧啟線、滬通線和沿海高鐵通道(童眼、蘇銅永嘉鐵路)的列車。
同時南通站從上海、蘇州始發，少量列車停靠該站。項目總用地面積12000，壹層公交站停車位32個，二層長途及公交停車場停車位32個。
擴展數據:
南通西站介紹如下:
項目總建築面積暫定為14245m2，項目總投資約為12000萬元。南通西站綜合交通樞紐長途客運站項目已由南通市行政審批局以《市行政審批局關於滬通鐵路南通西站綜合交通樞紐項目建議書的批復》(審批通過號。2019184).
項目業主為南通海通城市發展有限公司和南通城建集團有限公司，建設資金來自城建資金，項目出資比例為100%。已滿足招標條件，現對南通西站綜合交通樞紐長途客運站工程建設進行公開招標。
人民網-江蘇規劃建設南通西站等45個鐵路綜合客運樞紐。
人民網-滬通鐵路預計2019南通西站通車。