1.資金的性質不同。契約型基金的資金是通過發行基金份額募集的信托財產；公司基金的資本是公司法人通過發行普通股籌集的資本。
2.投資人的地位不壹樣。契約型基金的投資者在購買基金份額後，成為基金合同的當事人之壹。投資人是基金的委托人，即基於對基金管理人的信任，將自有資金委托給基金管理人進行管理和運作，同時也是基金的受益人，即享有基金的受益權。公司型基金的投資者在購買基金公司的股份後成為基金公司的股東。因此，公司型基金的投資者比契約型基金的投資者對基金運作的影響更大。
3.基金的運作基礎不同。契約型基金根據基金合同運作基金，公司型基金根據投資公司章程運作基金。