1.法律地位不同:有營業執照的企業是國家承認的，具有獨立法人資格，可以獨立進行經濟活動，簽訂合同。擁有知識產權的企業不以知識產權為主營業務，其法律主體地位不會因為擁有或不擁有知識產權而改變。
2.經營模式不同:擁有營業執照的企業主要從事各種市場交易，業務範圍廣泛，擁有知識產權的企業多由知識資產構成。
3.維權方式不同:有營業執照的企業在面對經濟糾紛時通過法院或仲裁機構解決問題，有知識產權的企業在遇到知識產權侵權時采用專利、商標法律手段維護自身權益。