獲國家和省級科技成果獎197項，其中包括雲南省首次頒發的突出貢獻獎。
“九五”期間進入省政府重大農業科技推廣計劃23項，承擔省農業綜合開發項目14項，科技成果示範推廣1.1億畝，增產糧食18億公斤，新增產值8.23億元。
2002年全院在研項目124項，其中新上項目36項，到位科技三項經費2267萬元；獲省部級科技成果獎勵13項，其中二等獎4項；通過省級審定新品種8個，獲植物新品種保護4個，獲國家發明專利1項；發表論文324篇。組織實施各類國際科技合作交流項目46項，到位經費312.9萬元。組織實施各類科技成果示範推廣項目69項，示範推廣面積1074.9萬畝，新增產值5.93億元。
“十五”以來，本所主持承擔國家自然科學基金項目多項，其中地區聯合資助重點項目2項，承擔國際合作、國家“973”子課題、“863”重點項目子課題、國家現代農業產業技術體系、公益性行業科研專項、國家自然科學基金等項目 項，省科技攻關、自然科學基金重點項目、以及企業委托的橫向科技項目140余項，發表論文400余篇，其中SCI收錄25篇，出版專著5部，其中科學出版社2部，獲國家發明專利10項，獲國務院特殊津貼1人，雲南省中青年學術和技術帶頭人11人，獲省部級科技成果獎10項，其中壹等獎2項，二等獎3項，成果累計示範推廣600多萬畝，新增產值6億元。