2011年9月被葛蘭素史克中國R&D中心授予“生命科學傑出成就獎”。2012被中國科協授予“全國優秀科技工作者”。
2015 9月19在中科大高等研究院舉行的2015求是獎頒獎典禮上，張廷棟獲得“求是傑出科學家獎”。
2015，2065 438+05，張廷棟教授榮獲第六屆中國中醫科學院唐氏中醫發展獎——中醫研究獎。
2016 65438+10月19，被評為“2015年度中國科學年度人物”。