電療和其他治療方法壹樣，電抽搐治療也有其特定的副作用和並發癥。現代改良電休克治療常見的並發癥主要是頭痛、惡心、嘔吐和可逆性的記憶減退。記憶減退出現的比例較高，國外研究發現至少有1/3的患者表示在接受電療之後，出現了明顯的記憶衰退。但是，壹般認為電休克治療對記憶的影響是有限的，並且通常只是暫時的，臨床上這些癥狀壹般在治療後都會自行好轉而無需處理。
現代電療除了上述副作用以外，還有不少缺點。首先，電休克治療實施起來較為復雜且有壹定的危險性，需要全麻和吸氧，基層醫院很難開展。其次，由於電休克治療技術和設備等要求高，所以治療費用也較高。再有，電休克治療和藥物治療壹樣不能壹勞永逸，要維持治療，否則許多患者的病情就會復發。所以壹般推薦在電療後的6個月裏，以藥物治療或者非經常性的電療作為後續維持治療
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