學院承擔國家重大基礎研究“973”項目、國家重大基礎研究前期研究專項、國家海洋“863”項目、國家自然科學基金重點項目等國家、省部級科技項目40余項。“十五”期間，項目資金達5700多萬元。1985年，國內首個具有國際先進水平的現代海洋西藥——PSS研制成功，並與後來開發的“糖酯”、“海利特”等海洋藥物和生物工程產品實現產業化。目前已有3個國家的壹類新藥(抗艾滋病海洋藥物潑尼松、抗腦缺血藥物D-聚甘油、抗動脈粥樣硬化殼聚糖酯)進入ⅱ期臨床研究；抗老年癡呆癥藥物HSH-971獲得新藥臨床研究批文，尿路結石抑制劑HSH-872完成新藥臨床應用；五年來，申請國內外發明專利81件，已授權23件；在SCI發表127篇文章。研究成果獲得全國科技大會獎、國家科技進步三等獎、山東省最高科學技術獎等10余項科技獎勵。
學院註重與國內外知名科研院所開展廣泛的學術交流與合作，與中國醫學科學院、上海藥物研究所、上海有機科學研究所、昆明植物研究所、中國軍事醫學科學院、中國預防醫學科學院等科研院所建立了長期有效的合作關系。我們與美國愛荷華大學、美國密歇根大學、瑞典烏普薩拉大學、德國杜塞爾多夫大學、法國布列斯特大學、丹麥羅斯基勒大學、加拿大麥吉爾大學、法國法國海洋所、荷蘭鹿特丹伊拉茲馬斯大學在資源共享、人員交流、學術交流、科研等方面建立了密切的合作關系。對外交流的擴大和合作的深化，促進了學院對外影響力和整體地位的穩步提升。
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