當事人可以按以下程序辦理質押合同登記：
1、簽訂專利權質押合同。
2、向中國專利局索取登記申請表，認真填寫並簽名用章。
登記申請表由中國專利局統壹印制。
3、按《辦法》第六條的規定提交（寄交或面交）以下文件：
（1）專利權質押合同登記申請表；
（2）主合同和專利權質押合同；
（3）出質人的合法身份證明；
（4）委托書及代理人的身份證明；
（5）專利權的有效證明；
（6）專利權出質前的實施及許可情況；
（7）上級主管部門或國務院有關主管部門批準文件；
（8）其他需要提供的材料。
4、按規定繳納登記費。
登記費可由當事人協商負擔。
5、當事人提交了齊備的申請文件並已繳費之日為登記申請的受理日，由此開始專利局起動審核程序，依法對登記申請進行審查。
6、需要補正的，當事人應當按補正通知書的要求進行補正。
7、不論登記申請得以批準與否，中國專利局均將以《通知書》形式將審查結果通知當事人。