1、專利行政訴訟中的證據主要是指書證、書證、電子數據。證人證言等，且以上證據經法庭審查屬實，才能作為認定案件事實的根據；
2、行政訴訟中，被告具有絕對的舉證責任，法律另有規定的除外；
3、專利行政訴訟中的其他證據問題。
法律依據
《中華人民***和國行政訴訟法》第三十三條
證據包括：
（壹）書證；
（二）物證；
（三）視聽資料；
（四）電子數據；
（五）證人證言；
（六）當事人的陳述；
（七）鑒定意見；
（八）勘驗筆錄、現場筆錄。
以上證據經法庭審查屬實，才能作為認定案件事實的根據。
第三十四條
被告對作出的行政行為負有舉證責任，應當提供作出該行政行為的證據和所依據的規範性文件。
被告不提供或者無正當理由逾期提供證據，視為沒有相應證據。但是，被訴行政行為涉及第三人合法權益，第三人提供證據的除外。