2、專利權歸屬不同，專利許可中被許可方僅能在壹定期限、壹定地區、以壹定方式實施許可方所許可的專利，並支付壹定的費用。專利所有權仍在許可方手中，被許可方僅僅只有有限的使用權，許可方有權轉讓其專利。專利轉讓則不同，轉讓人喪失所有專利權，受讓人獲得所有的專利權。受讓人成為新的專利權人，有資格完全支配該項專利。
3、生效條件的不同，專利許可只需通過許可方和被許可方訂立書面合同，以合同中的有關約定作為專利生效的主要參考條件。專利轉讓出需雙方當事人訂立合同外，還必須向管理專利的相關部門登記專利轉讓事項後方能正式生效。