專利是以公開技術內容換取法律保護的，您在申請專利的過程中要公開配方、用量、制備方法、使用方法、有效量等等內容，使您無秘可保。
專利申請並不復雜，而且如果有專業人士幫忙，也比較容易授權，只是會使秘方喪失保密性。
合法經營主要是通過進行藥品註冊，但只能以法人名義，而且費用極高，可能還需要臨床試驗。目前藥品轉讓環境不是很理想，我知道有壹些已經拿到臨床批文並且獲得專利的藥物都很難轉讓成功，所以建議您還是再考慮壹下。