超聲對人體的生物效應，與超聲功率和照射時間有關。低功率超聲波，照射時間有限，不會產生明顯的生物效應。盡管高強度超聲(>5W/cm2)用來粉碎結石，破壞腫瘤組織，具有強大的機械功率作用，但診斷用超聲只是利用超聲作為壹種信號，所需功率極小。
因此，多年來診斷用超聲壹直被認為是很安全的。在國際規定的安全閥值條件下，未發現任何明顯副作用，包括對胚胎和早孕胎兒的不利影響。
盡管超聲檢查是十分安全的影像學檢查方法，在日常超聲診斷工作中仍宜采取謹慎態度。即采用最小輸出功率，減少檢查時間，避免在固定部位(尤其是眼部和早期胚胎)做長時間照射，最大限度地減少產生超聲照射可能引起地某些副作用。