保密協議，主要就是不能將被代理的文字、圖紙等信息復制、仿造或泄露給除專利局以外的第三方，否則代理方承擔法律賠償。等價條款，如果未將全部資料信息交給代理方，而導致專利申請失敗，責任在被代理方。
壹般而言，如果沒有專門的保密協議的話，通常也會將保密協議的相關內容寫進代理協議；如果說某代理事務所，不願意簽保密協議且代理協議中夜沒有相關內容的話，只能說明其沒有代理資質，或不了解行規。