建院以來，醫院***取得42項科研成果，完成科研課題75項，獲得省科技進步二等獎2項，三等獎6項，甘肅醫學科技獎壹等獎2項，二等獎10項，三等獎24項。2000年以來，在研課題28項。獲甘肅醫學科技二等獎3項，三等獎8項，蘭州市科技進步二等獎1項，三等獎1項，申請國家專利8項。根據我省科技發展戰略，結合醫院科技能力和學科優勢，對科研科室設置作出了全面調整，提出“突出重點，提高能力，研發結合，開拓發展”的發展思路和戰略方針，確定了以生物技術和中藥現代化的研究開發為該院優先科技發展的方向和目標。已被鑒定達國際先進水平的《抗人血紅蛋白單克隆抗體及免疫試劑盒的研發》、獲國家自然基金支持的《抗體Fc片段特異寡核苷酸配基作為免疫傳感器的研發》及《潛血金標試紙條中試及申報新藥》、《安乳顆粒的開發研究》等7項省科研院所研發項目正在順利執行。建院30年以來，在省內外雜誌發表論文650余篇。