噬菌體制劑是現今比較前沿的制劑類型，將噬菌體用於人體的腸道菌群調節是目前最主要的應用。FDA也曾批準了噬菌體制劑的臨床試驗申請，也有噬菌體制劑用於食品行業。Floraphage是美國亞瑟安德魯醫學公司研制生產的高活性復合噬菌體制劑，是全球首款復合益生菌制劑，已經通過FDA認證。其裂解腸道內特定致病菌，同時支持有益菌落增殖，深度解決慢性腸炎、結腸炎，慢性腹瀉，慢性便秘，腸易激綜合征等消化道問題，以及由19種致病性大腸桿菌導致的尿道炎、膀胱炎、陰道炎、盆腔炎、前列腺炎癥等問題，因此來達到最佳的免疫和消化健康。
國內暫未報道過有噬菌體制劑的研究與藥品申報。其他行業諸如食品防腐劑，農畜牧漁等行業的應用也未見報道。由於技術較新，其使用成本相對較高，國內應用必然不是很廣，需要等幾年才會有更多進展。
況且抗生素目前還是主流抗菌產品，成本低廉使用方便，抗菌譜廣，除容易出現耐藥性外，其他方面均優於噬菌體制劑。當有壹天抗生素的耐藥性成為燃眉之急時，才會是噬菌體制劑的春天。