主持了國家重點研究計劃、“863”計劃、973計劃、科技支撐計劃和國家自然科學基金、總理基金項目等國家重大項目和多項省部級重點項目。截至2008年，已取得100多項科研成果，其中雜交水稻組合及其親本94個，品種和專利42項，得到廣泛推廣應用，增產效果顯著，社會效益和經濟效益巨大；獲國家級獎勵15項，省部級獎勵60余項，其中“實用光溫敏雄性不育系培矮64S的選育與應用”獲國家科技進步壹等獎；“優良亞種間雜交稻金優207的選育與應用研究”獲國家科技進步二等獎。特別是袁隆平院士成功發明培育的秈型雜交水稻，獲得了中國第壹個特殊發明獎，袁隆平院士還獲得了第壹個國家最高科學技術獎和聯合國教科文組織科學獎、以色列沃爾夫獎、世界糧食獎等16項國內外獎項。1995當選中國工程院院士，2006年當選美國科學院外籍院士。
已經出版了10多種關於雜交水稻的中英文書籍。其中，《雜交水稻育種與栽培》、《雜交水稻科學與雜交水稻生產技術》等專著已成為國內外雜交水稻領域的權威著作。《雜交水稻和雜交水稻育種與栽培》獲第壹屆、第六屆國家圖書獎，《超級雜交水稻研究》獲首屆中國出版政府獎。編輯出版的專業期刊《雜交水稻》在國內外有較大影響。
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