1.手術切除標本。此類標本取材完整，是分子檢測的金標準。
2.組織活檢樣本。此類樣本往往取材於支氣管鏡活檢、CT引導下組織穿刺、淋巴結活檢等。此類標本用於基因檢測獲得的結果可靠，在無法獲取手術樣本時是壹種替代手段。
3.細胞學樣本。包含胸水、腹水、支氣管刷檢、痰液等。獲取標本的方法微創、安全。但是此種標本往往量少，在基因檢測前需要評估樣本中的腫瘤細胞含量。腫瘤細胞含量少的或者腫瘤細胞有退變壞死的標本基因檢測效果不佳。
4.血液樣本。血液樣本具有無創、易采集等優點，但是存在壹定的假陰性率。
在臨床診療中，每個患者可以選擇的標本不壹樣。因此，與經管醫生充分溝通，選擇合適的檢測標本至關重要。