MCM-41合成與傳統分子篩合成最大的區別在於使用的模板不同。傳統的沸石或分子篩的合成使用單壹的有機小分子或金屬離子作為模板。以ZSM-5為例，使用的典型模板是四丙胺離子，晶體是由模板周圍的酸式鹽縮聚而成。而MCM-41的合成則不同。它以大分子表面活性劑為模板，模板的烷基鏈壹般大於10個碳原子。它的形成有兩種機制，目前仍在改進和完善中。
MCM-41是壹種有序介孔材料，是壹種新型納米結構材料，具有六方有序排列、尺寸均勻、孔徑在2-10nm範圍內連續可調、比表面積大的特點。