最急性的病例在出生後1天開始腹瀉，後軀布滿血樣和稀薄的糞便。病豬逐漸衰弱，拒絕行走，很快進入瀕死狀態。容易被母豬踩壞，直腸溫度降到35℃。死亡前腹部皮膚變黑，部分病豬可能不腹瀉就死亡。急性病例病程壹般持續2天，壹般第三天死亡。壹般亞急性病例無出血性腹瀉，排出黃色糞便，然後變為液體，內含灰色壞死組織碎片，類似米粥，消瘦脫水，壹般5 ~ 7天死亡。慢性病例表現為間歇性或持續性非出血性腹瀉，易與仔豬黃白痢混淆，用藥物治療黃白痢效果不好。
妊娠母豬註射A型和C型魏氏梭菌聯合疫苗可以很好地預防梭菌性腸炎的發生。