毒素篩選方法簡單快速。野生型細胞通常對毒素敏感，並且抗病突變細胞可以容易地被識別和檢測。細胞對毒素的抗性、再生植物對毒素的抗性和植物對疾病的抗性之間通常有很好的相關性。
用於細胞鑒定的毒素最好是具有已知化學結構的純毒素。粗毒素和病原體培養濾液不易標準化，可能含有多種毒素成分或其他生理活性物質。如果萬不得已才使用粗毒素或培養濾液，應盡量避免其他物質的幹擾。最好預先對已知抗病品種和感病品種的培養細胞進行處理，以便了解是否有鑒定效果，或者找出可用的鑒定特征。需要通過實驗來確定合適的處理濃度、處理時間和篩選次數。