UPLC具有以下優勢：
1.高分離度 根據液相色譜分離的解析度方程，解析度正比於柱效能的平方根 而根據範迪姆特（Van Deemter）色譜理論，柱效反比於系統固定相粒度大小。UPLC系統運用的固定相粒度能達到1.7μm，根據上述方程，該系統達到的效能將比5μm粒度系統高70%，而比3.5μm高40%。
2. 高速度 在保證得到同樣質量數據的前提下，UPLC能提供單位時間內更多的信息量。在不影響解析度的的情況下，小粒度能提供更高的分析速度，同樣也能使柱長減少，根據Van Deemter色譜理論，最優流速反比於粒度大小。
3. 靈敏度