為了保持優良菌株的特性，防止栽培用馴化靈芝的退化。在分離篩選菌種時，應采取相應的菌種保藏方法，延緩菌種退化，延長優良菌種的利用率。此外，要求每壹次分離和繁殖都不會對菌株造成不利的破壞，使其保持優良的菌株特性和旺盛的生長潛力。培養溫度不能過高或過低，高溫不能超過28℃，低溫不能低於18℃。培養基要適合靈芝菌種的生長，用手握緊時，水分要在手指間有輕微的沾色。所用菌齡不超過兩個月；預防接種過程中的機械傷害和燙傷；分離和擴大時，應丟棄表面菌絲。生產用栽培種經過多次轉管後容易出現性狀退化，需要從母種上取幾個分枝擴大為栽培種，防止栽培種因轉管次數過多而衰退。當現有菌株退化時，應采取措施使其復壯。除了改善培養基的營養條件外，最有效的方法是培養子實體，即滿足靈芝產生子實體的條件，使其完成有性世代，取靈芝子實體進行組織分離。選擇生命力強、發光度高、生長快、產量高的菌株，單獨培養，對退化菌株進行更新。富集培養基也可用於復壯。
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