穴盤育苗專用基質要求有良好的保水性和透氣性。由於每個穴盤的基質量很少，容易幹枯或缺肥，所以壹般混合使用堆肥、緩釋肥或培養土，既能促進根系發育，又能保證幼苗生長所需的養分，減少移栽時對根系的傷害。在我國壹些地區，肥沃的壤土和腐熟度好的優質糞肥按6: 4的比例混合，有泥炭土的地區，泥炭土與壤土和糞肥按4: 3: 3的比例混合。在每立方米配制好的營養土中加入腐熟糞便20公斤、氮磷鉀復合肥1.5公斤、草木灰5公斤、50%多菌靈可濕性粉劑80克、80%敵百蟲粉劑60克，混合均勻，過篩，作為育苗基質。