專利權人是妳跟導師的話，導師不反對就可以了，不用去哪裏申請，自己找途徑轉化就可以，比如自己實施或者許可他人實施，如果許可他人實施或者轉讓給別人的話簽合同要跟導師壹起同意，並且收益也是要分給他的。專利管理公司的專利如果妳已經按照合同轉給他們了，那就看妳們對於使用專利是如何規定的，如果沒有特別的規定，妳使用別人的專利是要經過別人同意（簽訂許可合同，到專利局備案），否則別人有權利來找妳要錢或者起訴妳。這個是兩個民事主體之間的活動，不用去什麽部門申請，只要雙方談妥即可。