申請專利無效的程序如下： 1、申請人提出無效的請求，並提交相關證據； 2、國務院專利行政部門對申請材料進行審查； 3、國務院專利行政部門依法作出宣告專利權無效的決定，通知請求人和專利權人，並進行登記和公告。
法律客觀：《中華人民***和國專利法》第四十五條 自國務院專利行政部門公告授予專利權之日起，任何單位或者個人認為該專利權的授予不符合本法有關規定的，可以請求國務院專利行政部門宣告該專利權無效。 《中華人民***和國專利法》第四十六條 國務院專利行政部門對宣告專利權無效的請求應當及時審查和作出決定，並通知請求人和專利權人。宣告專利權無效的決定，由國務院專利行政部門登記和公告。 對國務院專利行政部門宣告專利權無效或者維持專利權的決定不服的，可以自收到通知之日起三個月內向人民法院起訴。人民法院應當通知無效宣告請求程序的對方當事人作為第三人參加訴訟。