這藥口服吸收好，見效快。口服雙氫青蒿素2mg/Kg後，血藥濃度在1.33小時達到峰值，最大血藥濃度為0.71μg/m·l，血漿T1/2為1.57小時。它在體內分布廣泛，排泄和代謝迅速。磷酸吡喹酮經胃腸道吸收，24小時內吸收率為80% ~ 90%。吸收後分布於肝、腎、肺、脾等組織。給藥後8小時內，肝內劑量可達總劑量的1/4左右。藥物在體內慢慢消失，T1/2為9.4天。藥物隨膽汁排出，存在於腸肝循環中。
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