目前常見的鼠標接口有串口、PS/2、USB三種類型。
串口就是串行接口，即COM接口。是壹種9針或25針的D型接口，將鼠標接到電腦主機串口上就能使用。其優點是適用範圍和機型最多，缺點是串口通信的數據傳輸率太低，中高檔鼠標不能發揮其高性能優勢，而且不支持熱插拔。在最新的BTX主板規範中已經取消了串口，隨著BTX規範的普及，串口鼠標也必將逐漸被淘汰。
PS/2接口是目前最常見的鼠標接口，最初是IBM公司的專利，俗稱“小口”。這是壹種鼠標和鍵盤的專用接口，是壹種6針的圓型接口。但鼠標只使用其中的4針傳輸數據和供電，其余2個為空腳。PS/2接口的傳輸速率比COM接口稍快壹些，而且是ATX主板的標準接口，是目前應用最為廣泛的鼠標接口之壹，但仍然不能使高檔鼠標完全發揮其性能，而且不支持熱插拔。在BTX主板規範中，這也是即將被淘汰掉的接口。
USB是英文Universal Serial Bus的縮寫，中文含義是“通用串行總線”。其最大數據傳輸率分別是12Mbps和480Mbps，是壹種高速的通用接口。這是壹種新型的鼠標接口，與前兩種接口相比，其優點是非常高的數據傳輸率，完全能夠滿足各種鼠標在刷新率和分辨率方面的要求，能夠使各種中高檔鼠標完全發揮其性能，而且支持熱插拔。