萬方查重和知網查重存在壹定的區別，主要表現在以下方面：
數據庫覆蓋範圍不同：萬方論文查重系統僅包含有學術論文、學位論文、科技報告、專利論文等文字性的內容，不包括網頁、新聞內容等非文字性的內容；而知網查重系統則包含有學術論文、學位論文、科技報告、專利論文、網頁、新聞內容等文字性的內容。因此，在數據庫覆蓋範圍上，知網查重系統更為廣泛。
檢測算法不同：萬方查重系統采用的是切字符分割算法，即按照連續10個字以上重復的標準進行計算；而知網查重系統采用的是滑動窗口算法，即按照連續13個字以上重復的標準進行計算。因此，在檢測算法上，知網查重更為嚴格。
檢測結果不同：由於萬方論文查重系統僅包含有學術論文、學位論文、科技報告、專利論文等文字性的內容，因此在進行論文查重時，可能會出現論文內容被誤判為抄襲或漏檢的情況；而知網查重系統則包含更為廣泛的內容，因此檢測結果更為準確。
綜上所述，萬方查重和知網查重存在壹定的區別，主要表現在數據庫覆蓋範圍、檢測算法和檢測結果等方面。因此，在進行論文查重時，需要根據學校或期刊的要求選擇合適的查重系統。