專利保護的是軟件解決問題的思想，而軟件著作權保護的是軟件代碼(即軟件思想的表現形式)。
比如文件的離線傳輸，那麽發明專利保護就是如何實現文件的離線傳輸。基於同樣的軟件理念，在千千可以離線傳輸的程序代碼有壹萬種，每種代碼都可以享有自己的軟件版權。
申請壹項軟件發明專利的代理費約為5000-8000元。
發明專利申請可以直接向專利局提交，也可以委托代理機構提交:
1)提交專利申請文件(包括權利要求書、說明書、說明書附圖、摘要和摘要附圖)、專利請求書(包括發明名稱、申請人、發明人及相關資料等。)和向專利局繳納的專利申請費(即向專利局繳納的正式費用)。由此可以得到申請日和申請號，這是未來專利局審查的唯壹數字。正式錄取通知書將於申請日期後兩周內發出。
2)專利局進行審查(分為初步審查和實質審查兩個階段)，並出具審查意見通知書，要求申請人在規定的期限內答復。審查最終合格後，專利局發出授權通知書，表示同意授權。
3)專利授權公告在申請人辦理授權登記後生效。