首先，這個論文格式要看學校的，有的學校有自己的規定，最好先看看學校有沒有相關的要求。
妳的第壹個問題：具體的腳註和尾註的定義我不說了，我們在論文裏有需要註釋和引用參考文獻的地方，腳註可以用來做註釋的，就是妳覺得妳的某壹段話不加註釋，影響別人的理解，位置在頁腳；尾註在整個文檔結尾可以用來編參考文獻。
第二個：他們的格式，這個跟學校的要求是有關的。腳註壹般用帶圓圈的數字，尾註壹般是中括號帶數字。如［1］周振甫. 周易譯註[M]. 北京：中華書局，1991.和② 碘量法(即Winkler法)測定水體中的溶解氧：（當頁地腳註釋：宋體小五號，對應文中序號圓圈的阿拉伯數字進行註釋）
第三個：參考文獻裏不需要書名號的，中括號裏的英文字母表明了資料的來源，如著作是M，期刊是J，會議是C，報紙是N等等。我是文科的，如果妳是理科的話，應該還有專利P，數據庫DB等等。
按我們學校碩士論文的要求，參考文獻的末尾和人名後，壹般是用英文的句號，如果是多個作者的話，中間用中文的逗號就行。冒號壹般用在出版社所在地址的前面，如北京：人民出版社。
最後，比較重要的是正文和標題的格式，都是不同的。如果還有問題的話，我可以把我們學校的發給妳參考。