兩者區別：
首先，萘乙酸鈉主要是生主根，吲哚丁酸鉀主要是生側根，毛細根。
萘乙酸鈉在作物中的應用：
1、 促進細胞分裂和組織分化，用於果實膨大
2、
3、 及塊根塊莖的膨大。
2、誘導根和不定根的形成，用於加快扡插枝條生根和種子發根。還可以用於保花保果，提高產量，增強抗逆能力等。
吲哚丁酸鉀在作物中的應用：
1、吲哚丁酸鉀可以作用於植株全身各生長旺盛部位，如根、嫩芽、果實，對專壹處理部位強烈表現為細胞分裂，促進生長。
2、吲哚丁酸鉀具有長效性和專壹性的特點 3、吲哚丁酸鉀可以促進新根生長，誘導根源體形成，促進插條不定根形成。