中國大陸科學鉆探工程是我國有史以來最深的科學鉆井，也是當前正在實施的國際大陸科學鉆探計劃20多個項目中最深的科學鉆井。項目利用具有自主知識產權 、世界首創的“螺桿馬達-液動錘-金剛石取心鉆進技術”，首次在堅硬的結晶巖中成功鉆進5158米，取得了5118.2米的巖心和氣流體樣品。通過這次科學深鉆，我國科學家獲得了壹系列創新成果，揭示了板塊會聚邊界深部連續的物質組成、超高壓變質區的深部物質組成；證明了地質歷史上曾發生的板塊攜帶巨量物質俯沖地幔深處的壯觀地質事件，以及發生在700萬～800萬年前的重大裂解事件；標定了結晶巖地區典型的地球物理場；提出了地殼分層拆離的多重性和穿時性“深俯沖－折返”新模式。
項目已經獲得了2項國家發明專利，1項實用新型專利，出版了多部專著，發表了300余篇論文，獲得國土資源科學技術獎壹等獎2項、國家科技進步獎二等獎1項。5年間到鉆探現場進行合作研究或訪問的國際同行接近200人次，近3萬人參觀考察現場；2002年被評為公眾關註的中國十大科技事件；2004年科鉆中心榮獲全國五壹勞動獎狀，2006年被兩院院士評為十大科技進展之壹；***培養博士生有50余人，碩士生60余人，所建立的長期觀測站已成為東海縣青少年科普教育基地 。
中國大陸科學鉆探工程的實施，揭開了我國地質科學研究新的壹頁，對於探索地球深部動力學過程，發展大陸動力學理論具有重要的科學意義，同時建立的適用於深孔硬巖惡劣條件的新型鉆探技術體系，也使我國的鉆探技術水平上了壹個新臺階 。