中國地質科學院巖溶地質研究所主要承擔巖溶地質的基礎研究、區域調查評價、開發應用和科學實驗工作，形成了巖溶動力學與全球變化、巖溶資源評價與開發利用、巖溶生態系統與石漠化治理、巖溶地質災害防治與環境保護、巖溶景觀旅遊資源評價、巖溶探測與測試等優勢研究領域，設置有巖溶動力學重點實驗室、巖溶資源與環境調查研究院、巖溶生態與石漠化治理研究中心、巖溶地質災害研究中心、巖溶景觀與洞穴研究中心、環境地球化學研究測試中心等二級科研機構。巖溶動力學重點實驗室為國土資源部、廣西壯族自治區重點實驗室，巖溶生態系統與石漠化治理重點實驗室為中國地質科學院重點實驗室。
2009年，全所在研項目115項，其中，縱向科研項目40項、地質調查項目5項、社會服務項目43項、基本科研業務費項目27項，預算總經費7193萬元。發表論文79篇，其中SCI檢索期刊2篇，核心期刊42篇、出版專著2部。
所長兼黨委書記姜玉池（左二），副所長、黨委副書記兼紀委書記劉雯（右二），副所長黃慶達（左壹），副所長蔣忠誠（右壹）
2009年度重要科技成果
巖溶動力系統中土壤有機碳的動態及碳匯機制研究：地質調查工作項目“巖溶動力系統與碳循環”。項目通過對巖溶區與非巖溶區典型土壤剖面的調查，揭示了巖溶區土壤的富鈣偏堿性。巖溶區土壤的pH值和有機碳空間分布受到巖性、土地利用方式影響，石灰土的有機碳是地帶性紅壤的1.96倍。動態監測的結果顯示巖溶區土壤溶解有機碳僅為非巖溶區紅壤的1/6，而土壤呼吸排放量低於非巖溶區紅壤。通過土壤有機碳礦化培養試驗，利用三庫壹級動力學方程擬合出巖溶區土壤活性、緩效、惰性碳庫的庫容大小及周轉周期。
桂林毛村土壤水溶性有機碳DOC隨時間的變化，及石灰土與紅壤的對比
中國西南50萬年來石筍記錄的氣候事件與全球變化的響應：屬國家自然科學基金項目。項目對洞穴石筍進行精確U-230Th定年及高分辨的碳、氧同位素分析，初步建立中國西南35萬年及2萬年以來石筍記錄的標準時標序列，揭示了壹系列軌道尺度、短時間尺度的季風氣候突變事件。利用貴州荔波董哥洞D10、D8、D6-2及D3、D4的ICP-MS—230Th測年數據及氧同位素記錄集成了壹個完整的24萬年時標序列。
利用D4、J1和荔波衙門洞Y1石筍的230Th測年和碳、氧同位素數據，綜合集成了2萬年來的時標序列，不僅揭示了H1、OldestDryas、OlderDryas、Younger Dryas和8200年等突然變冷事件，而且還揭示在末次冰盛期的17.5～19kaB.P．間，存在的季風降雨增加事件，表明末次冰盛期為冷濕組合的氣候環境。
巖溶動力系統CO2-H2O-CaCO3碳循環過程及與有機碳循環的示意圖
貴州荔波董哥洞24萬年時標序列的綜合集成
巖溶石漠化區水土資源高效利用技術研究：國家科技支撐計劃、廣西科技攻關課題。通過小流域水土流失監測，進壹步論證了巖溶石山區坡面土壤主要由地下漏失，研究出水土保持的主要技術方法；針對不同的土地類型，研發出不同的土地整理、種植和灌溉技術，形成了2項專利技術。研究建立了典型巖溶區生態土地分類系統方案、生態土地優化配置評價指標體系和評價模型，構建了巖溶流域系統生態土地優化配置模式。建立完善了廣西平果果化、馬山弄拉、環江古周示範區，總面積2000多公頃。4個示範區的水土資源得到了充分合理高效利用，生態環境進壹步改善，實現了生態土地優化配置，構建了巖溶區特色的土地整理和水土保持技術模式，形成了生態產業。農民收入迅速增加，石漠化得到治理，生態經濟社會向良性循環方向發展。
水土流失與水土保持、土地整理
巖溶區種植火龍果
耐旱樹種篩選和引進樹種適應性研究——忍冬
喀斯特山地石漠化區植被恢復技術研究與示範：國家科技支撐計劃課題。針對重慶地區巖溶山地森林植被退化、石漠化加劇和旱災嚴重等生態問題，開展巖溶山地退化生態系統綜合治理的關鍵技術研究，建立適合巖溶山地生態產業發展的模式，提出生態環境恢復與重建的對策，進行試驗示範。生態重建試驗壹年之後證實，華南忍冬能夠增加土地覆蓋程度，改善水熱變化條件。
娘子關泉域桃河流域圖
中國北方巖溶區地下水環境問題成因機制與保護對策研究：國土資源部公益性行業科研專項經費項目。全面總結、歸納了我國北方巖溶泉域地下水環境問題及特征；選擇典型泉域進行深入研究，揭示了北方巖溶泉域水文地質環境問題成因及其演化驅動機制；提出巖溶水保護區劃分方案和保護措施。初步劃分邊界明確的巖溶地下水系統（子系統）116個，對其系統邊界水文地質性質進行了界定根據巖溶水系統地質結構與循環條件，將巖溶水系統劃分為單斜順置式、單斜逆置式、平行置式、盆地型、其他式5種主要北方巖溶水系統模式，對其系統結構、資源要素及轉化關系、巖溶水文地質環境問題的差異性進行了歸納總結。針對不同的環境地質問題對個典型泉域（娘子關泉域、河南九裏山泉域、山東棗莊十裏河泉域開展了專題研究。
碳酸鹽巖縫洞系統模式及成因研究：“973”計劃項目第壹課題。通過典型巖溶露頭區與井下縫洞系統的精細描述和對比研究，建立了古巖溶地貌成因的組合識別方法，掌握了塔裏木盆地油氣藏奧陶系不同地貌單元古巖溶縫洞系統的發育特征，劃分了巖溶臺地、巖溶緩坡、巖溶陡坡和巖溶山間盆地4種二級地貌類型。對塔河油田試驗區碳酸鹽巖縫洞系統進行了地質識別，建立了塔河油田4種地貌單元古巖溶垂向結構模式；分析了塔河油田試驗區不同古巖溶地貌單元油氣富集特征，建立了六大類10種古巖溶縫洞系統發育模式，建立了古巖溶地球物理識別方法，掌握了塔裏木盆地油氣田奧陶系古巖溶縫洞系統地球物理響應特征。開展了塔河油田試驗區構造應力場模擬，從構造裂縫形成的動力機制出發，運用脆性巖石破裂準則，預測研究區構造裂縫的發育狀況，為建立塔河油田試驗區裂縫預測模型提供了理論支持。
丘峰窪地類型古巖溶垂向結構模式
多期次、多旋回裸露風化古巖溶演化模式
貴廣鐵路雄村—賀州段巖溶地質與線路比選咨詢研究：結合鐵路工程的特點和需要，深入分析了研究區基礎地質條件、巖溶發育特點、巖溶層組及含水巖組劃分、巖溶塌陷機理、潛在危險性分區、列車動荷載作用下誘發巖溶地面塌陷效應、巖溶地球物理勘探的有效性、三大線路方案巖溶地質特征、線路巖溶地質條件比選原則和評判方法、最終的線路方案比選綜合評判等重點問題。將地理信息系統技術運用到鐵路工程地質病害調查所獲得的多源空間數據的處理和危險性綜合評價中，實現了數據管理的可視化、自動化，提高了評價結果的科學性和可靠性，取得了較好效果。
巖溶發育程度對塌陷的影響分區專題圖
洞穴環境遠程監測及承載力定量評價：開展了我國不同氣候地貌區代表性洞穴調查與空氣環境自動監測工作。在廣西桂林蘆笛巖、廣西河池水晶宮、海南儋州石花水洞、重慶武隆芙蓉洞、河北興隆陶家臺溶洞建立了洞穴空氣環境遠程自動監測系統，對洞穴空氣環境的溫度、濕度、CO2、O2等因子進行高頻度遠程自動監測，掌握了洞穴空氣環境的變化規律，探索了旅遊洞穴環境因子變化對洞穴沈積物景觀的影響，建立了洞穴環境承載力評價指標體系，定量評價了洞穴環境承載力，為制定洞穴開發保護政策措施提供了技術支撐。
監測和傳輸系統
實時監測與顯示
西南巖溶石山地下水及環境地質調查：地質大調查計劃項目。從1999年起，組織西南8省（區、市）地調院以及航遙中心、水環中心、中國地質大學等單位，聯合實施“西南巖溶石山地下水及環境地質調查”計劃項目。完成1:25萬水文地質編測66萬km2、1:5萬水文地質和環境地質綜合調查12.32萬km2、水文地質鉆探25500m、地下洞穴探測長度60km、綜合地球物理探測55000物理點、建立巖溶地下水自動化監測站7處。
西南巖溶石漠化分布圖
掌握了西南巖溶區水資源量及其開發利用潛力，為地下水開發利用提供了技術支撐；查清了巖溶石漠化的分布狀況及其發展趨勢，掌握了巖溶石漠化形成的主要機制，提出了不同巖溶環境地質類型石漠化治理措施，為正在開展的石漠化治理提供了依據。查清了典型流域巖溶水文地質條件和環境地質問題，制定了流域內巖溶水開發工程方案和地質環境綜合整治區劃，成果已被多個部門應用於調查區開發治理工作中。針對不同類型區開發條件，因地制宜，采取堵洞蓄水、暗河截流、大泉壅水、鉆井、大口井、斜井等多種方式，開展了巖溶地下水開發利用與生態環境綜合治理示範，解決了40多萬人飲用水、30多萬畝耕地的灌溉用水問題，取得了明顯的社會效應與經濟效益。建立了西南巖溶石山區地下水與環境地質信息系統，實現了地質調查成果的信息化。地調與科研相結合，開展了綜合性的研究工作，實現了地質調查工作的科技創新。
中國地質科學院年報.2009
地下河及溶窪堵洞成庫
選擇不同類型巖溶地下水系統進行地下水監測，研究了水質、水量動態與巖溶動力系統的相互關系；揭示了典型地下河流域水質水量20年來的變化及與土地利用變化的關系，掌握了地下水系統、土壤和植被對巖溶自然環境和人類活動變化的敏感性，建立了環境脆弱性評價指標體系及模型。
廣西平果縣果化表層巖溶水開發與生態恢復示範