建校以來，學校積極開展科學研究與創新，在西南地區交通和三峽工程建設的重大科技攻關中取得了大量有影響的成果，成功解決了西部地區300多項交通建設關鍵技術，產生了30多億元的直接經濟效益和巨大的社會效益，如解決了鋼管混凝土世界第壹跨徑拱橋——重慶萬縣長江大橋的設計與施工關鍵技術難題，為三峽工程175m水位線決策和施工通航方案論證提供了重要技術支持等。
學校在拱橋修建技術、內河通航及港口航道建設等領域居於世界領先水平。近五年，先後承擔了國家科技攻關計劃等國家級科研項目近70項，省部級科研項目300余項；2009年獲國家科技進步獎3項，在教育部全國高校2009年度國家科技獎勵統計排名中名列第16位；2011年科研經費達1.5億元,2012年2月14日，由我校主持，聯合交通運輸部公路科學研究院、中交第壹勘察設計院等七家研究單位***同研究，由學校周建庭教授、周誌祥教授、顧安邦教授等老師多年刻苦攻關的研究成果“山區拱橋建設與維護新技術研發及應用”榮獲2011年度國家科技進步二等獎。2000年以來，學校先後獲得國家科技進步壹、二、三等獎及國家發明獎11項、國家教學成果獎2項，省部級科技進步獎500余項，20余項科技成果被列為國家和省部級重點推廣項目。 鄭皆連（1941.7.17 -），男，中國工程院院士，路橋工程專家。重慶交通大學橋梁與隧道專業1965屆校友，重慶交通大學特聘教授。1968年首創我國雙曲拱橋無支架施工新工藝，解決了不立拱架修建拱橋的難題。1976年主持設計了廣西第壹座無支架施工鋼筋砼箱拱橋，十多年中修建此類大橋達40多座2萬多延米，占當時廣西公路大橋總數70%。1992年任邕寧邕江大橋鋼骨鋼筋砼拱橋設計與施工技術研究課題組組長和大橋專家組組長，建成了當時世界最大跨徑的鋼筋砼肋拱橋，他提出了千斤頂斜拉扣掛懸拼架設拱骨架技術和連續澆註拱肋外包砼技術，國內首創，廣泛推廣。
韓其為（1933.11.2－），男，漢族，湖北省松滋縣人。中國工程院院士，泥沙（運動）與河床演變（水庫淤積）專家，重慶交通大學特聘教授。自1964年開始，韓其為采用力學與隨機過程相結合的方法，對泥沙運動統計（隨機）理論進行了長期研究。研究獲水利部論文壹等獎，國家自然科學三等獎。前國際水利學會主席林泰造和肯尼迪等著名學者對其評價很高。國家自然科學基金委專家鑒定認為：“研究建立了較為完整的泥沙運動統計理論體系，有顯著的開創性”，“達到國際領先水平”，“推動了泥沙運動理論的發展”。
梁應辰（1928.8.30－），河北保定人，1994當選為中國工程院院士，水道和港口工程專家，高級工程師（教授級），重慶交通大學特聘教授。作為三峽工程航運專家，參加了三峽工程各個階段有關航運工作，對三峽工程壩址選擇，技術攻關，科學論證，重大關鍵技術問題的解決做出了貢獻。
王夢恕（1938.12.24－），河南省溫縣人，隧道及地下工程專家，中國工程院院士，重慶交通大學山區橋梁與隧道工程國家重點實驗室培育基地名譽主任。王夢恕院士從事鐵路工程科技工作40余年，在隧道及地下工程的理論研究、科學試驗、開發新技術、新方法、新工藝以及指導設計、施工等方面做出了突出的貢獻，取得了豐碩的成果，對促進我國隧道建設技術的發展起到了重要作用。
顧安邦（1935.10－），男，漢族，江蘇無錫人，博士生導師，重慶交通大學教授。1957年畢業於同濟大學土木系，同年分配到成都工學院土木工程系任教，1960年院系調整隨遷重慶交通學院，曾任重慶交通學院副院長。2006年6月10日，茅以升科技教育基金委員會第十五屆頒獎大會在北京中國科技會堂舉行。在此次頒發的6個不同類別的茅以升科學技術獎中，顧安邦教授榮獲其中最具影響力的獎項——橋梁大獎。截至目前，全國高校中僅有4人獲此殊榮。
劉忠（1963.8－），博士，教授，政府特殊津貼獲得者。國家“百千萬人才工程”第壹、二層次人選、交通部十百千人才工程第壹層次人選、交通部跨世紀學術帶頭人。主要從事大跨徑橋梁施工控制、橋梁非線性與空間分析研究。在大跨徑拱橋幾何非線性、材料非線性分析及施工控制等研究方面成果突出。完成和承擔了多個科研項目先後獲得國家級、省部級獎勵5項、發表論文30余篇。
周誌祥（1958.4.11－），男，漢族，教授，博士生導師，首批新世紀百千萬人才工程國家級人選，交通運輸部新世紀百千萬人才第壹層次人選，重慶市橋梁與隧道學科學術帶頭人，山區橋梁與隧道國家重點實驗室培育基地主任，全國土木工程學科教學指導委員會委員，重慶交通大學土木建築學院黨總支書記。主持國家級項目4項、省部級項目20余項，發表論著100余篇部，獲得發明專利十余項；主研完成“大中型橋梁檢測、維護、加固技術研究”獲得國家科技進步二等獎；主持完成“橫張預應力砼梁工藝及性能試驗研究”，獲得重慶市科技進步壹等獎；主持完成“橋梁結構損傷機理與神經網路”，獲得2008年度重慶市技術發明二等。2000年來獲得省部級以上科技成果獎***9項；在“橋梁結構行為與新技術”研究領域取得突出成績，獲“全國交通系統青年科技英才”等多種榮譽稱號。
陳洪凱（1964.10－），男，重慶江津人，教授，博士生導師。新世紀百千萬人才工程國家級人選，國務院政府特殊津貼，全國優秀教師，振興重慶爭光貢獻個人。迄今，代表性專著有《危巖崩塌演變理論及應用》《公路泥石流力學》《公路泥石流研究及治理》《危巖防治原理》《巖石邊坡滲流與排水機理研究》；發表論文210篇，被SCI收錄6篇、EI收錄29篇、ISTP收錄2篇；獲得發明專利6項、實用新型專利5項；國家科技進步獎二等獎1項、省部級科技進步獎壹等獎1項、二等獎6項、三等獎3項。研究成果處於國際先進、國際領先水平，得到同行專家高度贊賞。研究成果在西部地區大量推廣應用，解決了8000多公裏幹線公路沿線的泥石流、危巖崩塌災害，確保了三峽庫區50多萬人的生命財產安全。
周建庭（1972.9.8－），浙江金華人，教授、博士生導師，新世紀百千萬人才工程國家級人選，教育部新世紀優秀人才、國務院政府特殊津貼專家，全國優秀科技工作者。圍繞結構安全監測、評價與加固方向開展科學研究，主持和主研了國家科技攻關項目、國家自然科學基金項目等國家、省部級項目20項，主持橫向項目25項。