2005至2010年間，東華理工大學科研成果獲國家或省部級獎勵54項。其中國家級獎勵9項，省部級獎勵43項。***有17項自然科學類、人文社科類科研成果分獲省級壹、二、三等獎。獲各級各類科研項目596項，其中國際原子能資助項目6項，國家級科研項目36項，省部級科研項目244項。
2010～2013年間，學校發表科研論文6000余篇，其中被SCI、EI、ISTP及SSCI收錄1000余篇，出版專著、教材、譯著80余部。獲國家級或省部級獎勵54項，發明專利10項。承擔各級各類科研項目近800項、2012年科研項目經費突破1.2億元，居江西第二。2010年10月，該校兩篇科技論文首次入選2009年“中國百篇最具影響國際學術論文”。 2015年11月，根據《科技部關於認定農業航空應用技術國際聯合研究中心等23家單位為2015年度國家級國際聯合研究中心的通知》（國科發外[2015]352號）文件精神，經江西省科技廳推薦、科技部組織專家評審、研究確定，東華理工大學“質譜科學與儀器國際聯合研究中心”被認定為2015年度國家級國際聯合研究中心，這是江西省首個國家級國家聯合研究中心，實現我校國家級國際聯合研究中心零的突破。
截至2015年4月，學校擁有核資源與環境國家重點實驗室培育基地、放射性地質與勘探技術國防重點學科實驗室、國際原子能機構參比實驗室等12個國家級、省部級重點實驗室（工程技術中心、人文社科重點研究基地），以及鈾資源勘查與開發協同創新中心和質譜科學與儀器協同創新中心2個江西省“2011協同創新中心”和4個省部級科技創新團隊 。
（壹）國家級國際聯合研究中心
1、東華理工大學“質譜科學與儀器國際聯合研究中心”
（二）國家級實驗教學示範中心
1、放射性地質國家級實驗教學示範中心
（三）省部級重點實驗室
1、核資源與環境——江西省重點實驗室、教育部重點實驗室（省部***建國家重點實驗室培育基地）
2、“放射性地質與勘探技術”國防重點學科實驗室
3、江西省數字國土重點實驗室（2004年2月被確定為省級重點實驗室）
4、江西省環境地球化學重點實驗室（省財政廳、省教育廳）
5、“地球環境”實驗室（科技部國際合作基地和江西省國際合作基地）
6、“核資源與環境”國際合作基地
7、江西省質譜科學與儀器重點實驗室
8、納微構築化學國際合作聯合實驗室南昌分支機構
9、“流域生態與地理環境監測”國家測繪地理信息局重點實驗室（東華理工大學與江西省測繪地理信息局、江西師範大學和井岡山大學聯合***建的國家測繪地理信息局重點實驗室） 。 （四）工程研究中心
1、分析測試研究中心（國際原子能機構指定參比《仲裁》實驗室，具備核地學重大科研課題的研究與測試）
2、“核技術應用”教育部工程研究中心
3、“核輻射探測及應用”江西省工程技術研究中心
4、核設施數字工程實驗中心（江西省重點實驗室）
5、地質資源經濟與管理研究中心
（五）博士後科研工作站
1、江西省核資源與環境重點實驗室博士後科研工作站
（六）博士後科研流動站
1、東華理工大學地質資源與地質工程博士後科研流動站 據2013年學校官網顯示，東華理工大學圖書館圍繞學校學科建設和專業發展，逐漸形成了以核地球科學、核技術、核分析化學、 水文地質與工程地質、測繪工程學科文獻以及臨川文化研究資料為重點收藏，文理管兼收的文獻資源保障體系。
東華理工大學圖書館館藏紙質圖書159萬冊，電子圖書41萬冊，購買了CNKI、超星數字圖書館等十多個大型文獻數據庫，並自建了臨川文化名人、學科導航等特色數據庫。 東華理工大學堅持開放式辦學理念，積極開展全方位、多層次的國際交流與合作，陸續派出專家、教師出國考察，參加國際學術會議，據2013年學校官網顯示，***出訪20多個國家、80多批次、220多人次。2006年以來，先後派出10多位科學家去日本科技廳就高放廢物地質處置問題開展合作研究。
與美國、俄羅斯、日本、澳大利亞等20多個國家或地區的高校和科研院所建立了長期校際交流和學術聯系，並互派留學人員。與聯合國國際原子能機構在科學研究、人才培養等方面建立了長期交流與合作關系。學校還長期聘任國外資深專家來校任教。