海門市人民醫院下設多個科室，包括： 普外科 普內科 眼科 口腔科 婦產科 泌尿外科 兒科 耳鼻喉科 肛腸科 皮膚科 鎮痛科 中醫科 胸外科 骨科 心內科 腎內科 感染科 神經外科 神經內科 消化內科 呼吸內科 血液內科 康復理療 普外科技術力量雄厚，擁有主任醫師3名，副主任醫師5名，設二個病區（八、九病區），82張床位。主要收治普外範圍內常見病、多發疾病，以及疑難、復雜、危重、罕見疾病。其中包括：頸部腫塊、甲狀腺疾病、乳房良惡性腫瘤、胃腸道及直腸肛門的各種病變、膽囊膽管結石及其他病變、肝癌、肝囊腫、肝血管瘤、胰腺疾病、門脈高壓癥、脾腫大、脾亢、疝氣、下肢靜脈曲張、各種體表腫瘤、軟組織腫瘤等。
特色專業技術：開展原發性肝癌的手術切除、B超或CT引導下註射乙醇治療肝癌、肝囊腫和肝膿腫的抽吸治療、胃腸道手術各種吻合器械的應用、直腸癌低位保肛手術、甲狀腺腫瘤的手術治療等。腹腔鏡下能完成膽囊切除、疝修補術、蘭尾切除、肝囊腫切除微創手術，腹腔鏡手術創傷小，病人無痛苦，術後恢復快。專科已成功地為15個月幼兒行腹腔鏡蘭尾切除術，創造了全國微傷外科手術年齡最小先例。全體醫務人員將竭誠為廣大患者朋友提供壹流的醫療保健服務。 產科建科已有五十多年，為全市創辦最早的產科病區，專科技術實力雄厚，有多名資深專家和壹支業務精湛的醫護隊伍，承擔著本市及周邊地區婦女孕期保健宣教、產後診視等工作，除處理正常生產外，在診治妊娠合並癥、並發癥等高危妊娠方面有獨到之處，在治療產後大出血、產科DIC、產褥感染、新生兒窒息的搶救、早產兒的救治等工作有著豐富的實踐經驗。
為了滿足不同層次的服務需求，產科在南通地區率先開展無痛分娩等無痛系列技術，還開展了家人陪伴分娩（導樂分娩）等特色服務項目。2004年3月經中華醫學會兒科醫學分會、中華醫學會圍產醫學分會、中華護理協會認證獲得全國首批新生兒撫觸、嬰兒遊泳資質證書。2004年12月創辦孕婦學校，免費為圍產期婦女及家屬講授圍產期保健及相關知識。母嬰安康，是全體醫務人員的最大心願。
產科是以醫療為主，集教學、科研為壹體，有正、副主任醫師各壹名，主治醫師多名，承擔著本市及周邊地區婦女疾病的診斷、治療、計劃生育、預防保健等工作，對婦科常見病如子宮腫瘤、附件腫瘤、異位妊娠、盆腔炎癥、老年婦女常見的子宮脫垂、會陰舊裂、尿失禁等病有較強的診治能力。在全市最早開展處女膜修補、陰道緊縮及會陰部整形等矯形手術，並率先引進腹腔鏡技術，診治婦科常見病。對婦科惡性腫瘤采取術前介入治療、盆腔清掃等手術，其治療方法與國際接軌。在南通市範圍內最先開展無痛人流、上環診治等技術。 血液凈化中心主任，南通市腎臟病協會委員。
擅長於腎衰、腎功能不全、糖尿病、甲狀腺病等疾病的診斷和治療。對血尿、蛋白尿、頑固性腹水有獨特治療辦法。專長於尿毒癥透析治療，各種毒物和藥物中毒患者透析搶救及壞死性胰腺炎、多臟器衰竭等急救，近期又開展透析病人永久性保留雙腔導管植入術。 施敏，副主任醫師，急診科主任，南通醫學院兼職副教授，南通市血液學會委員。
擅長血液系統疑難疾病的診治，對各種貧血、出凝血性疾病、免疫性血液病、白血病、淋巴病、骨髓瘤及骨髓增生異常綜合癥有較高的診治水平。曾在蘇大醫學院參加全國血液進修班學習壹年。在治療中註意藥物治療與心理疏導同時進行，使許多血液疑難病患者得以康復。 刁振鴻，副主任醫師 骨科病區副主任。
1989年畢業於南通醫學院。曾赴南通大學附屬醫院和上海市第六人民醫院進修深造，多次參加全國骨科學術交流，從事骨科臨床工作十余年，經驗豐富。擅長四肢骨折創傷及脊柱關節疾病的診治。 朱樹人，主任醫師，中華醫學會委員，中華醫學會南通市分會理事，南通醫學院兼職教授。
擅長心腦血管病、癲癇、腦炎、老年性癡呆、帕金森病以及頭痛、肢體癱瘓等病癥的診斷、治療及康復。曾參與國家衛生部科研項目五項，在中華級醫學雜誌上發表論文六篇，有發明專利二項，其中壹項獲國家專利局及省人民政府專利創新獎。1997年被評為南通市勞動模範。