醫院擁有1省級重點實驗室，1省級分析測試中心，2個省級工程技術研究中心，3個中試孵化基地，5個院級工程技術研究中心。1980以來，醫院承擔科技項目2400余項，取得科技成果1480項，專利90余項，獲得國家級、省級科技成果獎450余項，出版專著190余部，在國內外學術期刊發表論文3800余篇，其中多篇被SCI、EI、CA引用。
(2)建立了綜合試驗基地。截至1999，省財政和我院共投入2387萬元(其中省財政投入460萬元)，建設占地205畝的綜合中試基地。現已建築面積19122平方米，建設了河南高新綜合實驗基地、河南省科學院高新新鄭實驗基地、鄭州沙門化工中試基地三個中試基地。基地本著開放、合作、服務的原則，建立了省級重點實驗室，為省內科技人員和歸國留學人員進行小試提供條件；基地內有中試車間，為高科技項目中試提供場所；該基地有壹個標準的廠房，為成果的成熟提供示範。基地為科技企業的研發、中試和孵化創造了條件。6家高新技術企業和壹批在省內外有較大影響力的項目進入基地孵化。
(3)形成了壹批高新技術企業。自1985國家作出科技體制改革決定以來，科研機構的事業費逐年減少。我院根據依靠科技的方針，鼓勵廣大科技人員加快科研成果轉化，面向經濟建設主戰場。近年來，已註冊科技型企業60余家，經省科技廳認定的高新技術企業15家，高新技術產品近60種。2000年銷售收入8000萬元。以生物工程技術為基礎，開發了壹批國家級和省級新產品，形成了自己的特色和優勢。壹系列醫用體外診斷試劑獲得衛生部新藥證書4個，生產批準文號14。已推廣應用60多種產品，銷售網絡遍布全國。以矽肥研究成果為基礎的矽肥生產成套技術在全國推廣，26家矽肥廠投產，為培育新的經濟增長點做出了貢獻；食用菌的研究、開發、應用和推廣對我省食用菌產業的形成和發展起到了重要的推動作用，為我省培養了1多萬名食用菌技術人員，累計創造經濟效益20多億元。
(4)與國內外科研機構和高校建立了長期穩定的合作關系。科研體制改革以來，我院加強了與國內著名科研機構和重點高校的合作，聘請了10名院士，其中包括中國化學會理事長梁、浙江大學陳耀祖、中科院上海有機所盧希言、北京大學馮新德、翟忠和、南京大學高、中國醫學科學院俞德全、 清華大學趙、中國科學院、中國科學院倪光南，負責重大項目研究工作或擔任客座研究員。 為加快高層次人才培養，我院化學所、地理所、能源所、應用物理所、生物所分別與中國科學技術大學、天津大學、蘭州大學、鄭州大學、河南大學、河南師範大學聯合培養研究生，為我院改革發展奠定了良好的人才基礎。在國際科技合作與交流方面，與美國、日本、英國、德國、俄羅斯、澳大利亞、韓國等20多個國家的科研機構和高校建立了長期穩定的合作關系。