侯洵從事瞬態光學技術研究，先後以主要參加者、學術帶頭人和題目負責人身份親自參與研制了壹系列國內首創、國際先進的電光與光電子類型的高速攝影機。
1985年系列超高速瞬態現像觀測設備的研制與其它靶場觀測儀器壹起獲得了題為“現代國防試驗中的動態光學觀測及測量技術”的國家科技進步獎特等獎。侯洵獲個人獲獎證書，排名第五。
為進壹步發展中國瞬態光學技術和促進超快現像研究，他倡議並組織了“瞬態光學技術國家重點實驗室”的申請立項工作，獲得成功。1991年組織“飛秒激光技術與超快過程研究”“八五”攀登計劃項目立項申請，獲準後被國家科委聘為該項目首席科學家。該項目包含飛秒激光技術、超快速測量技術及超快過程研究三部分，由六所六校的有關科技人員***同承擔，完成得很好：1996年國家科委驗收時整體評為A級。1997年起，作為 “九五”攀登計劃預選項目“強場激光物理與飛秒超快過程研究”的專家組召集人之壹，承擔過超快過程研究部分的組織工作與課題研究，2001年該項目騐收時聘為A級。
此外，侯洵還於七十年代負責研制成功磁聚焦雲母片耦合四級像增強器；在國內最先研制成功了透射式砷化鎵陰極和場助光電陰極；八十年代初發明了長波響應高、面電阻小、穩定性好的鈀銀氧銫陰極；在國內首先研制成功雙近貼聚焦像增強器；發明了使用電子陷阱材料的組合紅外光電陰極；發明了壹種新型高效X射線光電陰極並獲得了中國和美國發明專利；1990年研制成功直徑100毫米的微通道板X射線像增強器，當時在國內外領先，獲中國專利。為解決常規武器靶場探測暗、小、快、多目標的難題，他提出了采用脈沖激光照明、幹涉濾光片抑制背景、像增強器增強目標圖像的辦法，成功地研制出了中國新壹代靶場光測設備，1992年獲國家科技進步獎二等獎。他重視科研成果的轉化工作，曾主持設計並制造了成套像增強器制造設備，出口創匯191萬美元。
2000年受聘該校教授以來，與吳洪才教授壹起主持了985工程的重大項目“海量信息技術”，領導開展了信息的超高密度光存儲、光通信用無源器件、低損耗有機光纖等的研究工作，建立了“陜西省信息光子技術重點實驗室”。
1984年被國家人事部授予“中青年有突出貢獻專家”稱號。
1989年被國務院授予“全國先進工作者”稱號。
1991年被選為中國科學院學部委員（現改稱院士）。
2002年被聘為國家自然科學基金委數理學部咨詢專家委員會委員。
2002年被聘為陜西省第二屆決策咨詢委員會特邀委員。
現任中國光學學會常務理事、高速攝影與光子學專業委員會主任，陜西省科協副主席、陜西物理學會理事長，中國物理學會理事。