水生生物學是生命科學重要的分支學科，與水產養殖，漁業科學關系極為密切。它依托於已有30多年辦學歷史的水產學院，隨著學院的發展逐漸發展、形成和壯大，在全國具有壹定的影響力。2005年以優異的成績獲得教育部碩士學位授予點。本學科現有教授3人，副教授10人，具有博士學位10人，具有碩士學位11人。學術隊伍中50歲以上的3人，40歲至50歲的2人，其余均在40歲以下。梯隊結構合理，學術隊伍年輕、有活力。國家級“新世紀百千萬人才工程”人選1名，集美大學優秀青年骨幹教師第二層次和第三層次3名。入選福建省高等學校新世紀優秀人才支持計劃2名。
本學科主持國家自然科學基金5項（包括子課題2項），省市科技項目20多項，三年內承擔的科研項目經費累計300多萬元。
近年來，本學科獲得省市科技進步二、三等獎的有5項，自然科學優秀論文獎5項，已完成了2項國家863計劃項目和1項國家自然科學基金項目，10多項省市級科研項目，並均順利通過鑒定或驗收。發表論文150多篇，其中，SCI收入20多篇。 1996年集美大學水產學院設立漁業科學與技術系，並向教育部申請設立了漁業經濟管理和海洋漁業科學與技術兩個專業，其中漁業經濟管理專業從98年開始招收本科生，海洋漁業科學與技術專業從1999年開始招收本科生。多年來為全國輸送了大量的漁業資源學專門人才，在全國具有壹定的影響力。2005年以優異的成績獲得教育部漁業資源學碩士學位授予點。2007年又以優異的成績獲得教育部漁業領域農業推廣碩士碩士學位授予點。
本學科現有教授4人，副教授8人，講師8人，具有博士學位10人。學術隊伍中46歲以上的1人，36歲至45歲的10人， 35歲以下10人。梯隊結構合理，學術隊伍年輕、有活力。1人享受國務院政府特殊津貼，2人入選福建省“百千萬人才”工程，1人入選福建省高等學校新世紀優秀人才支持計劃，1人入選集美大學優秀青年骨幹教師第壹層次。
目前本學科主持國家自然科學基金等國家級、省部級、市局級等科研項目10多項，三年內承擔的科研項目經費累計300多萬元。近年來，本學科獲得省市科技進步二、三等獎的有7項，自然科學優秀論文獎1項，發表科研論文100多篇，其中，SCI收入10多篇。
本學科有五個主要研究方向：漁業生物學；漁業資源評估與管理；漁業政策與管理；漁業環境評價與保護和漁業生態學等。經過多年的努力和發展，已形成了在我省乃至國內同類學科中具有明顯優勢和特色的研究方向。 水產養殖學是集美大學辦學歷史最久的學科之壹，1972年上海水產學院南遷廈門時就設置了與水產養殖學相關的淡水養殖學專業，緊接著設置了海水養殖學，1998年淡水養殖學與海水養殖學合並為水產養殖學。2004年水產養殖學被福建省確定為省級重點學科。
該學科現有專任教師67人，其中教授、研究員14人，副教授26人，博士37人，碩士14人。在職攻讀博士學位的教師10人，留學歸國人員20多人。享受國務院政府特殊津貼專家4人，全國師德之星1人，全國先進教育工作者1人，農業部有突出貢獻中青年專家2人，入選國家級百千萬人才工程1人，入選省級百千萬人才工程6人，入選福建省高等教育學校新世紀優秀人才支持計劃4人、福建省青年“五四”獎章1人，廈門市拔尖人才1人，廈門市“五壹”勞動獎章1人。
該學科教學、科研條件良好，擁有福建省水產病害防治技術研發中心、廈門市飼料檢測與安全評價重點實驗室，現有儀器1700多臺件，價值2100萬元。實驗室面積3000多㎡。2007年學校投入750萬元更新改造建設該學科的實驗基地，目前實驗基地的循環水等設備達國內同類實驗基地的先進水平。此外與15個校外水產苗種繁育與飼料生產企業建立了產學研合作關系。
2002年以來承擔項目128項：國家863項目（含合作）12項、國家自然科學基金項目（含合作）19項、國家公益性行業（農業）科研專項1項，國家海洋局項目1項、福建省自然科學基金項目9項、福建省科技重大專項6項、福建省科技項目21項、福建省青年創新基金項目8項、市、廳級科研課題27項、其他科研課題27項。經費3800多萬元。
近3年科研成果40多項。其中省、市科技進步獎16項、國際先進成果3項、國內領先成果10項、驗收結題成果31項、申請和取得專利12項。在國內外多種學術刊物發表學術論文290多篇，其中被SCI、ISTP、EI收錄40多篇。出版專著和教材10部。
該學科重視國內外的學術交流與合作，近年來已與美國、日本、英國、法國、新加坡等十多個國家和臺灣、香港地區的同行學者進行了學術交流。 集美大學動物營養與飼料學是福建省最早成立的主要面向水產動物營養研究和飼料產品開發的學科。自1997年國家批準設立“水產動物營養與飼料”專業，迄今已為國家輸送了大批水產動物營養與飼料方面的專門人才，為我國的水產養殖業和水產飼料工業的發展做出應有的貢獻。本學科現有研究人員11人，其中教授/研究員3人，副教授3人，博士8人。十多年來，該學科壹直得到國家、省部級和市級相關課題的資助，通過不斷的發展，逐漸形成了以魚蝦營養與飼料為研究重點，以魚蝦營養與代謝調控、飼料生物技術與飼料添加劑、飼料工程與產品質量控制及飼料資源的開發與利用為研究特色的研究團隊，在牙鮃、大菱鮃、石斑魚、對蝦、鮑魚等海水養殖動物配合飼料和添加劑預混料的研究上取得多項達到國內領先、部分達到國際先進水平的成果。5年來獲省部級科技進步壹等獎壹項、二等獎四項、三等獎四項，廈門市科技進步二等獎壹項，其中,達到國際領先水平,並獲福建省科技進步二等獎和漳州市科技進步壹等獎的“牙鮃南方人工育苗及產業化示範”項目,成功地開發出牙鮃系列飼料並實現產業化生產。2004年以來在國內外學術刊物上發表論文102篇，主編或參編教材3部。目前該學科點承擔的在研項目***有18項，研究經費171萬元。