南京醫科大學是江蘇省重點大學。其前身是江蘇省醫藥管理學院。成立於江蘇省省會鎮江市，1934。1937年抗日戰爭爆發，遷至湖南沅陵。1938年與南通學院合並，更名為國立江蘇醫學院。1939遷居重慶北碚。抗戰勝利後，他遷回鎮江。1957遷至南京，更名為南京醫學院。1970與南京中醫學院合並，更名為江蘇新醫學院。1978脫離南京中醫學院，恢復南京醫學院校名。1993，經國家教委批準，更名為南京醫科大學。
學校設有基礎醫學院、公共衛生學院、醫政學院、藥學院、護理學院、口腔醫學院、第壹臨床醫學院、第二臨床醫學院、第三臨床醫學院、鼓樓臨床醫學院、繼續教育學院、高等職業技術教育學院、康達學院***13二級學院。除了第壹附屬醫院、第二附屬醫院、附屬口腔醫院外，還有11非附屬醫院，南京、常州、無錫、蘇州、淮安等地的33家教學醫院。
學校有1148教職員工。本部專任教師568人，其他職稱教師35人；三所直屬醫院專任教師人數按全部具有博士職稱人員的15%計，為129人；校外聘用教師人數按專任教師1/4折算為174，教師總數為906人。學校聘用教授、副教授(含附屬醫院和其他教學基地兼職教師)人數分別為395人和990人，其中博士生導師95人，碩士生導師310人。國家“百千萬人才工程”壹、二級教師1人，新世紀百千萬人才工程國家級教師1人，有突出貢獻的中青年專家2人，國家傑出青年科學基金獲得者2人，享受國務院政府特殊津貼的專家16人，國家級優秀教師4人，被授予“霍英東教育基金會”高等學校。教育部優秀骨幹教師1人，全國衛生系統先進工作者2人，江蘇省“有突出貢獻中青年專家”14人。
我校現有全日制學生7283人，其中本科生4494人，七年制學生884人，碩士生637人，博士生214人，高職學生270人，成人784人。
學校目前設有臨床醫學(含兒科醫學)和口腔醫學兩個七年制專業。臨床醫學、口腔醫學、預防醫學、護理、醫學影像、醫學檢驗、康復治療、藥學、英語、公共管理等本科專業10，其中醫學法醫學專業(醫學、法學)、衛生法制專業(管理學、法學)為。
目前，學校擁有病原生物學、病理與病理生理學、藥理學、內科學、外科學、皮膚性病學、勞動衛生學、環境衛生學等7個省級重點學科。基礎醫學、臨床醫學、預防醫學博士後流動站3個，壹級學科(基礎醫學)博士學位授權點1個，二級學科博士學位授權點20個，二級學科碩士學位授權點42個。
學校有五臺和江寧兩個校區，總占地面積1173754 ㎡。教學行政樓總面積127029 ㎡，學生宿舍建築面積61372 ㎡，運動場地總面積4641300 ㎡。學校教學科研儀器設備總值654.38+0.0925億元。
圖書館是江蘇省醫學圖書中心圖書館，是高校文獻保障體系的醫學文獻中心。目前共藏書1.04033萬冊，其中紙質書61.876萬冊。
建校70年來，學校向江蘇及全國各地輸送了近4萬名本科生和1500多名博士生、碩士生。
近年來，我校獲得國家級優秀教學成果獎2項，省級優秀教學成果獎15項。
學校擁有1省級重點實驗室(人類生殖調控與危害評估重點實驗室)，7個江蘇省重點實驗室和工程(技術)研究中心(現代病原生物學、生殖醫學、應用毒理學、人類功能基因組學重點實驗室，藥物、農藥、獸藥安全性評價與研究中心，基因表達工程研究中心，基因醫學技術中心)。
2001至2003年，我校共獲得國家項目1477.7萬元，省、市、部項目1014.9萬元。國家自然科學基金項目穩步增長，從2001到2004年分別為17、15、23和25項。2004年，學校獲得國家自然科學基金重點項目1項，國家傑出青年基金2項。學校還參與並承擔了“973”、“863”等9項國家重大科研項目。2001至2003年，學校獲得省級科技進步獎66項，其中壹等獎3項，二等獎10項，三等獎53項。2004年，又有兩項科技成果獲得國家科技進步二等獎。學校還獲得了6項國家發明專利和11項實用新型專利。2001至2004年6月，學校以第壹作者和第壹作者單位發表SCI論文124篇。
學校主辦《臨床皮膚病學》、《臨床神經病學雜誌》、《江蘇醫學》、《南京醫科大學學報》等學術期刊10種(含自然科學版、英文版、社會科學版)。
改革開放以來，學校開展了廣泛的對外交流與合作。學校與美國、日本、加拿大、法國、德國、英國、奧地利、澳大利亞、俄羅斯、尼泊爾、印度、巴基斯坦和香港的醫學教育、醫療、科研機構建立了雙邊合作和學術交流關系，聘請了多名知名專家學者擔任學校名譽教授和客座教授。同時，學校還派出500多名教師出國交流訪問和學習。南京醫科大學是衛生部批準的國家級培訓基地之壹，也是教育部批準接收外國留學生的高校之壹。與南京大學、東南大學、南京農業大學壹起，成為江蘇省四大高層次人才培養基地之壹——“333工程”培養基地。