色譜進樣瓶以玻璃材質為主，極少是塑料材質。壹次性使用的進樣瓶成本高、浪費大、對環境汙染嚴重，大多實驗室都是將進樣瓶清洗後重復利用。
目前，實驗室常用清洗進樣瓶的方法主要都是加入洗衣粉、洗滌劑、有機溶劑及酸堿洗液，然後用定制的小試管刷洗。
這種常規的刷洗法缺點很多： 洗滌劑和水的使用量大，洗滌用時長，容易留有死角，如果是塑料進樣瓶，易在內部瓶壁留下刷痕，占用大量人力資源。對於脂質和蛋白質殘留汙染嚴重的玻璃器皿，采用堿性裂解液進行清洗，取得良好的效果。
LC/MS/MS分析樣品時,進樣瓶的清洗非常重要。 按玻璃儀器洗滌方法根據汙染程度選擇清洗方法，沒有固定的模式 。
方法總結：
方案壹：
1.倒幹瓶內試液
2.全部浸入95%酒精，超聲洗2次後倒幹，因為酒精易進入1.5mL的小瓶，且能與大多數有機溶劑互溶以達到清洗效果。
3.倒入清水，超聲洗2次。
4.倒幹瓶內洗液，於 110攝氏度烘1～2 小時 ， 絕對不能於高溫下烘烤 。
5.冷卻，保存。
方案二：
1.自來水沖洗幾遍
2.放入倒有純水（Millipore水機）的燒杯中，超聲15分鐘
3.換水，再超聲15分鐘
4.泡在倒有無水乙醇（國藥集團，分析純）的燒杯中
5.最後取出自然風幹。
方案三：
1.先用甲醇(色譜純）浸泡（（有些浪費(⊙o⊙)哦）），並超聲清洗20分鐘，後將甲醇倒幹.
2.再將進樣瓶內註滿水，超聲清洗20分鐘，後將水倒幹.
3.後將進樣瓶烘幹
方案四：
（第壹種）壹般都是先用清水沖洗烘幹後?再用硫酸重鉻酸鉀洗液浸泡
（第二種）進樣瓶的洗法和做液相等其他是壹樣的，首先使用醫用酒精侵泡4個小時以上，然後超聲半個小時，然後倒出醫用酒精，使用水超聲半個小時，用水沖洗後烘幹就可以了
方案五：
1.如果費用充足，每次用新的最好。
2.如果要重復使用，清洗的方法也很重要，首先用強氧化清洗液（重鉻酸鉀）浸泡24小時，然後用去離子水在超聲波條件下清洗三次，最後用甲醇清洗壹次，烘幹即可使用。
3. 瓶墊壹定要換成新的，特別是分析農藥殘留時，壹定要換，否則會影響定量結果了，但如果條件允許的話，還是盡量使用壹次性消耗品 ，比如，使用那種壹次性的聚四氟乙烯的內插管或者國產的那種塑料內插管（0.1元/只左右），樣品瓶就可以反復使用且不需要清洗。
方案六：
如果還是傾向於發揚勤儉節約的優良作風，建議如下：
（壹） ? 繁瑣的清洗，踏實的結果：
No1.樣品瓶使用後，先用流動的水沖洗壹下樣品瓶，將剩余的樣品沖掉（同時可以用手甩壹甩）；
No2.然後將樣品瓶放入重鉻酸鉀洗液泡，當累積到壹定數量或者哪天心情好的時候，從洗液缸撈出來，放到壹個廚房用塑料篩子裏，用自來水充分沖洗，中間可以反復篩搖；
No3.沖洗後先用自來水超聲清洗3次左右，每次超聲清洗後最好都將樣品瓶裏的水甩出去；
No4.再用三蒸水（或者純凈水，去離子水）同1.3超聲清洗三次；
No5.再用色譜純甲醇超聲清洗2～3次，每次清洗後同樣最好將樣品瓶中甲醇甩出去；
No6.將樣品瓶放到烘箱中， 80 度左右烘幹 ，可用。
（二） ? 購買用不同顏色標記的樣品瓶： 不知大家註意沒有，樣品瓶上有壹小塊塗了顏色的標記，那可不是為了好看，有其使用意義的。購買時，最好買幾種不同顏色的瓶子。
舉個例子：
您實驗室同時開張A，B兩個項目，第壹次A項目使用白色的樣品瓶，B項目使用藍色樣品瓶，檢測完成後按照上面的方法清洗好後，第二次實驗時，A項目選用藍色樣品瓶，B項目用白色樣品瓶，以此類推，可有效避免汙染給您的工作帶來的麻煩。