公司從2000年進入垃圾焚燒發電領域，是國內最早從事該領域的專業化公司之壹。公司於2003至2005年先後建成深圳南山、鹽田、寶安三座垃圾焚燒發電廠，垃圾日處理能力2450噸，年處理能力達100萬噸，建設運營標準均達到了當今國際先進水平。其中，南山垃圾發電廠是引進國外先進設備建成的示範項目；鹽田垃圾發電廠是消化吸收引進技術後建成的國家級國產化設備示範項目；寶安垃圾發電廠位列中國可再生能源產業藍天榜“中國十大垃圾焚燒發電廠”。公司正在建設的新項目有：深圳東部（5000噸/日）、南山二期（800噸/日）、寶安二期（3000噸/日）、湖北武漢（1000噸/日）等。新項目將於2011年後陸續建成投產，屆時公司的垃圾日處理量能力將達到12250噸。其中，深圳東部項目將成為全球最大的垃圾焚燒發電廠。
深能環保下屬的設計研究所是國內第壹家由企業成立的致力於垃圾焚燒發電、煙氣處理和廢水深度處理研究和設備研發設計的專業機構，擁有壹批優秀的研發設計人員，具有雄厚的科研力量。設計研究所在成功引進並消化歐洲先進的垃圾焚燒和煙氣凈化系統技術的基礎上，經過十年的探索和潛心研發，全面掌握了國際領先的垃圾焚燒處理及相關的環保技術，並且創新發明了多項核心技術，獲得了國家實用新型專利，填補了國內空白。其中，垃圾滲瀝液熱力法處理技術（CEAB）成功應用於鹽田和南山垃圾發電廠；燃煤電廠脫硫廢水深度處理技術成功運用於河源電廠（2X600 MW），使河源電廠成為國內首個實現廢水“零排放”的電廠。
深能環保於2007年通過了ISO9001:2000（質量管理體系）、ISO14001:2004（環境管理體系）和OHSAS18001:1999（職業健康安全管理體系）認證，為公司的發展奠定了良好的管理基礎。
深能環保近期將按照《深圳市新能源產業振興發展規劃》的產業布局，圍繞核心技術優勢，建設新能源環保裝備產業基地及國家級重點技術實驗室，進壹步提升核心競爭力，保持深能環保在城市生活垃圾處理、電廠脫硫廢水處理、汙泥處理等領域的競爭優勢。
深能環保還是深圳市政府確定的垃圾處理“投融資體制企業化、建設發展規模化、技術設備國產化”改革試點單位。經過不懈的努力，深能環保得到了社會各界的贊譽和肯定。