技術秘密具有秘密性，是不對外公開的；而專利技術具有公開性、獨占性、新穎性等特點。
壹般來講,專利因其被公開(保密專利除外)而不能被稱為技術秘密。技術秘密是指商業秘密中的技術信息，又有人稱之為專有技術，英文為know－how。根據《中華人民***和國反不正當競爭法》第十條規定，所謂商業秘密，是指不為公眾所知悉、能為權利人帶來經濟利益、具有實用性並經權利人采取保密措施的技術信息和經營信息。商業秘密可以包括但不限於權利人的設計資料、程序、產品配方、制作工藝、制作方法、管理訣竅、客戶名單、貨源情報、產銷策略等技術信息和經營信息。其中，不為公眾知悉，是指該信息不能從公開渠道直接獲取，它能為權利人帶來經濟利益。具有實用性，即該信息能為權利人帶來現實的或者潛在的經濟利益或者競爭優勢，權利人采取保密措施，包括訂立保密協議，建立保密制度及采取其他合理的保密措施。
以專利加技術秘密的方式保護自身的發明創造，有助於發明創造的保護。將易於公開的技術申請專利，而同時又將不易公開的技術以技術秘密方式保留。他人照著專利技術生產，可以生產出產品，但若不能獲得技術秘密則難以生產出優質等效的產品，專利加技術秘密的雙重保護，通常要比單純專利或技術秘密的單項保護效果要好。
有許多相同的地方，但也有區別。
（1）技術秘密保護要比專利制度保護範圍大，凡是能夠用專利制度保護的技術都可采用技術秘密制度來保護，專利制度不能保護和不需要保護的技術，如“可口可樂”的配方、“同仁堂”中成藥的配方以及前面提到的瑞士手表的裝配工藝等，均采用技術秘密的方式進行保護。（2）專利制度不能脫離技術秘密制度獨立存在，如在專利申請之前不采取保密措施，發明創造有可能泄
密公開而喪失新穎性從而不能得到專利保護。發明創造從開發到專利申請、授予專利權時間跨度可能很長，這段期間也需要技術秘密保護。壹些不在專利中公開的技術、階段性的技術成果以及技術資料都可以采取技術秘密保護，作為專利技術的補充。反之，技術秘密可以脫離專利而獨立存在。
（3）技術秘密的保護更需要借助持有人自身的力量，從內部人員、制度、管理上控制；專利則是依照國家法律法規保護。當然，技術秘密的保護目前已經逐步納入國家法律法規保護範圍，竊取技術秘密並造成重大損失的也要判刑。
（4）技術秘密是不公開的技術，只要技術不被公開，企業對技術就有長期控制和壟斷權利，特別是對技術難度大，其他企業和個人在短期內不能開發出來的技術保護更有力。專利是公開的技術，所有人不能限制他人研究和模仿，其保護期也有限。
（5）不同的持有人持有相同的技術秘密時，持有人都享有相同的利益，相互不能排除其他人開發同樣的技術，享有相同的權利。同時也不能排除他人通過對技術秘密控制人的產品進行“反向工程”，得到這項技術；而專利權人則有絕對的排他權。也就是說，上述技術秘密的持有人有壹方申請專利了，技術秘密就變成公開的技術，他就得到了排他權，可以限制另壹方繼續使用該“技術秘密”。