學院現擁有藥學壹級學科博士學位授權點和壹級學科碩士學位授權點(覆蓋藥理學、藥物化學、藥劑學、微生物與生化藥學、藥物分析、生藥學等全部二級學科)，設有“藥學博士後科研流動站”，擁有藥學碩士專業學位授權點和工程碩士（制藥工程領域）專業學位授權點。擁有藥學、中藥學、生物技術（生物制藥）等三個本科專業（含專業方向），藥學專業為校特色專業，江蘇省壹級學科重點學科。
學院科研力量雄厚，實驗條件完善，先後主持國家重大新藥創制計劃項目、國家“973”項目、“863”項目、國家“十壹五”支撐計劃、國際合作重點項目、國家自然科學基金重點項目、國家自然科學基金面上項目和青年項目等各級科研課題數十項。擁有教學科研用房兩萬平方米，用於教學科研的先進儀器設備配備充足。 蘇州大學藥理學科是歷史悠久的學科，創建於上世紀50年代初期的原南通醫學院，距今已有六十年建設史，是我國醫學院校中較早建立的藥理學教研室之壹。1984年獲國務院學位委員會批準為碩士學位授予點；2002年被批準為蘇州大學重點學科；2003獲國務院學位委員會批準為博士學位授權學科，2008年在原藥理學教研室的基礎上成立蘇州大學醫學部藥理學系。
藥理學科的主要研究方向為神經與精神藥理學、腫瘤藥理學與分子腫瘤藥理學、心血管藥理學與腦血管藥理學、分子診斷和肺纖維化藥物防治及藥物蛋白組學。承擔了多項國家重大、重點項目，包括國家傑出青年基金項目（1項）和國家自然科學基金重點項目（2項）、國家973項目（1項）、863項目（2項）、國家基金委重大項目培育項目（1項）、國家自然科學基金面上課題（12項）、國家自然科學基金青年課題（6項）、江蘇省高校優勢學科建設工程資助項目（1項）、江蘇省雙創計劃人才項目（2項）、江蘇省自然科學基金資助項目（5項）及其多項省部級課題科研任務。已申請國家發明專利12項，其中獲得國家知識產權局授權專利6項。正在進行的創新藥物研究4項。2005-2010年，以第壹完成單位在國際學術刊物發表SCI論文150多篇。衰老與神經疾病實驗室（2007年）及心血管研究室（2009年）先後被評為蘇州市重點實驗室。藥理學科實驗室總面積達到5000 平方米，儀器設備總值近2000萬元（2010年），設有離子通道研究室、激光掃描***聚焦室、分子生物學室、行為藥理學實驗室、血流動力學室、高效液相色譜分析室、藥物篩選實驗室、藥物提取分離研究室、SPF級動物房、小動物活體成像室及流式細胞儀等多個實驗室。 序號 姓名 學科領域 認定年份 1 秦正紅 藥理學 2003 2 楊世林 天然藥物化學 2007 3 喬春華 藥物合成 2008 4 鎮學初 藥理學 2009 5 李凱 藥理學 2009 6 楊金銘 藥理學 2009 7 陳大為 藥劑學 2009 8 毛新良 藥理學 2009 9 侯廷軍 藥物合成 2009 10 張洪建 藥物代謝動力學 2011 11 王光輝 藥理學 2011 12 張小虎 藥物合成 2012 13 許國強 化學生物學 2012 14 劉峰 藥物化學 2012 （以上資料為2013年摘自該學院官網 ）