1，太空戰艦大和號(1974，松本零士)，機動戰士高達(1979，Yosiyuki Tomino)，新世紀福音戰士(1995，庵野秀明)，號稱“日本動畫史上的三次高潮”。這個標題更關心的是對整個動畫行業的影響。《宇宙戰艦大和號》讓日本觀眾第壹次意識到，動畫也可以承載有分量的內容，而不僅僅是孩子的專利。從那以後，針對年輕人甚至更高年齡段的動畫就更多了。
機動戰士高達，讓機動戰爭片(蘿蔔片)政治化，摒棄“非善即惡”的傳統觀念，讓劇情和思想空前復雜，同時打造出經久不衰的動畫系列(高達系列)，相關模型遊戲成為制片方獲利的重點；EVA是日本動畫長期低迷中突然冒出來的壹匹黑馬。它不僅在內容和表現上有很大創新，在相關商業運營體系上也非常成功。
尤其是面對社會年輕壹代迷茫封閉的內心狀態，EVA已經成為壹種社會現象。EVA是動漫產業的壹針強心劑。之後的日本動畫，內容更豐富，表現形式更多樣，市場分化更細致。到現在為止，還沒有壹部動畫在推動行業方面與以上三部並行。(也許新房昭之2011的《魔法少女的小圈子》才是，但需要時間檢驗)
2.新世紀的福音戰士，機動戰列艦撫子(1996，喬雄佐藤)，少女革命(1997，幾原邦彥)，號稱“90年代三大宅男(宅男)動畫”。題主問的問題可能和這個很接近。這三部動畫壹方面有大量的neta致敬內容，另壹方面也確實是高質量的不落俗套的作品。即使不是宅男，不關註neta的觀眾也會印象深刻。它不同於現在的“孟非動畫”。在那個市場剛剛向宅男傾斜的年代，出現了這樣的三部動畫，很容易把現在的作品扼殺掉。沒有這種工作誰會走上神壇？所以壹提到“三大名著”，ACG圈裏經常會想到這三部作品。以上純屬個人觀點！