學院在葡萄野生種質資源與抗逆基因利用、西北果樹種質資源利用與創新、黃土高原優質果業生產關鍵技術、西北果樹逆境生理、西北果樹采後生理與貯藏技術、蔬菜種質資源與育種技術、蔬菜生理生態、設施園藝工程、西北野生花卉種植資源與利用、陜西茶產業技術等研究領域的優勢突出，特色鮮明。學院***承擔國家 “863”、國家自然科學基金、國家科技攻關及省部等各類科研項目239項，年到位研經費達4000余萬元。自“六五”以來，已取得省部級科研成果123項，其中，1988年育成的‘秦冠’蘋果新品種榮獲國家發明二等獎，1991年主持完成的“眉縣萬畝矮化蘋果園建設”科技成果榮獲國家星火計劃四等獎，1993年主持完成的“國家果樹種質資源葡的建設”和“抗病優質高產線椒新品種‘8212’育種栽培和推廣” 科技成果分獲國家科技進步二、三等獎，1996年育成的“大白菜胞質雄性不育系列新品種”榮獲國家發明三等獎，2001年主持完成的“西瓜壹代雜種育方法的創新及 ‘西農8號’新品種的選育和推廣” 科技成果榮獲國家科技進步二等獎。2003年主持完成“優質、抗病、豐產秦白系列大白菜新品種示範與推廣”榮獲國家科技進步二等獎。育成新品種200多個，累計推廣面積約6000萬畝，創經濟效益200億元以上，社會、經濟效益顯著，為陜西乃至西北地區園藝產業及農業經濟的發展作出了重要貢獻。基礎研究和基礎應用研究方面也取得了壹大批重要成果，先後有24篇論文被SCI、EI收錄，申請發明專利39項，授權發明專利8項，出版專（編）著74部。
學院與國內外100多所科教單位有學術往來，先後有國內外專家學者200余人次前來學院講學或開展合作研究，派出專家教授60多人次前往美、英、德、日本等20多個國家進行合作研究，並成功舉辦國內學術會議10余次。
多年來，學院堅持科學、和諧發展，不斷強化管理，深化改革，穩步推進了黨建和精神文明建設工作，促進了各項事業的快速發展。2006年學院黨委被陜西省教育工委評為陜西高校優秀基層黨委，2001年、2006年學院黨委被校黨委評為先進基層黨委，2004年、2005年、2006年連續三年學院被學校評為先進單位。